北京近期的疫情反复让人始料未及，且带来了多个未解之谜。其中最让人关注的是病毒来源问题。目前国内权威专家基于实验室检测结果，初步判断病毒有可能来自欧洲，甚至美洲。异于中国本土流行的新冠病毒，为中国疫情防控带来了新的挑战。

15日下午，武汉大学医学部病毒研究所杨占秋教授接受《环球时报》记者采访时表示，北京新发地4天内确诊79个病例，说明北京新发地发现的新冠病毒传染力有可能强于武汉华南海鲜市场；采访中，他还认为若病毒是从海外经冷鲜生物类产品输入，那么“外防输入”中所包含的内容就要扩大到对这些产品的海关检疫上；另外，病毒类型不同，对疫苗研发也有影响，杨占秋认为这增加了疫苗研发的难度。

北京市疾控中心新冠肺炎疫情防控专家组成员杨鹏日前表示，通过全基因组测序发现病毒是从欧洲方向来的，初步判定与输入性有关。15日，中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友表示，病毒“肯定不是北京原发地发生的，是从外地引进的”。他判断病毒“更像欧洲的”，来自欧洲或者是美洲。

15日，杨占秋向《环球时报》分析说，如果确诊病例感染的病毒类型与新发地市场环境中采样的病毒类型完全吻合，且都来自欧洲，那么病毒通过食品或者从欧洲“带进”中国的指向就比较明确了。基于此，杨占秋倾向于将北京新发地暴发的局部疫情定义为输入性疫情。